Protein–RNA interactions for Protein: Q5YKI7

GGNBP1, Putative gametogenetin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGNBP1Q5YKI7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GGNBP1Q5YKI7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms