Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWQ0

RSBN1, Round spermatid basic protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSBN1Q5VWQ0 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RSBN1Q5VWQ0 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RSBN1Q5VWQ0 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RSBN1Q5VWQ0 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RSBN1Q5VWQ0 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RSBN1Q5VWQ0 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RSBN1Q5VWQ0 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RSBN1Q5VWQ0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RSBN1Q5VWQ0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RSBN1Q5VWQ0 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RSBN1Q5VWQ0 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RSBN1Q5VWQ0 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RSBN1Q5VWQ0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RSBN1Q5VWQ0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RSBN1Q5VWQ0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RSBN1Q5VWQ0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RSBN1Q5VWQ0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RSBN1Q5VWQ0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RSBN1Q5VWQ0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RSBN1Q5VWQ0 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RSBN1Q5VWQ0 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RSBN1Q5VWQ0 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RSBN1Q5VWQ0 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RSBN1Q5VWQ0 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RSBN1Q5VWQ0 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
RSBN1Q5VWQ0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RSBN1Q5VWQ0 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RSBN1Q5VWQ0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms