Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HES3Q5TGS1 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms