Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SOGA3Q5TF21 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms