Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXF1

FAM74A3, Putative protein FAM74A3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM74A3Q4VXF1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM74A3Q4VXF1 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms