Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00303Q3SY05 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms