Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KNOP1Q1ED39 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KNOP1Q1ED39 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
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