Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABRA6Q16445 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms