Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZFHX3Q15911 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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