Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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BRD3Q15059 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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BRD3Q15059 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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BRD3Q15059 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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BRD3Q15059 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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BRD3Q15059 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
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BRD3Q15059 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BRD3Q15059 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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