Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCAPHQ15003 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
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