Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMCO1Q147U7 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
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