Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IHHQ14623 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IHHQ14623 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IHHQ14623 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IHHQ14623 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IHHQ14623 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IHHQ14623 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IHHQ14623 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IHHQ14623 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IHHQ14623 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IHHQ14623 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IHHQ14623 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IHHQ14623 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IHHQ14623 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IHHQ14623 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IHHQ14623 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IHHQ14623 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IHHQ14623 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IHHQ14623 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IHHQ14623 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
IHHQ14623 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IHHQ14623 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
IHHQ14623 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
IHHQ14623 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
IHHQ14623 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
IHHQ14623 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
IHHQ14623 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IHHQ14623 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
IHHQ14623 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IHHQ14623 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IHHQ14623 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
IHHQ14623 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
IHHQ14623 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
IHHQ14623 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
IHHQ14623 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
IHHQ14623 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
IHHQ14623 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
IHHQ14623 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
IHHQ14623 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IHHQ14623 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IHHQ14623 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
IHHQ14623 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
IHHQ14623 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IHHQ14623 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
IHHQ14623 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IHHQ14623 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
IHHQ14623 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IHHQ14623 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IHHQ14623 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
IHHQ14623 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
IHHQ14623 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
IHHQ14623 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IHHQ14623 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IHHQ14623 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
IHHQ14623 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IHHQ14623 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IHHQ14623 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
IHHQ14623 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
IHHQ14623 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IHHQ14623 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IHHQ14623 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IHHQ14623 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IHHQ14623 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IHHQ14623 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IHHQ14623 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IHHQ14623 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
IHHQ14623 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
IHHQ14623 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
IHHQ14623 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
IHHQ14623 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IHHQ14623 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
IHHQ14623 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
IHHQ14623 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IHHQ14623 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
IHHQ14623 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IHHQ14623 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IHHQ14623 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
IHHQ14623 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
IHHQ14623 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
IHHQ14623 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
IHHQ14623 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
IHHQ14623 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
IHHQ14623 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
IHHQ14623 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IHHQ14623 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IHHQ14623 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
IHHQ14623 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
IHHQ14623 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IHHQ14623 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
IHHQ14623 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
IHHQ14623 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IHHQ14623 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
IHHQ14623 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IHHQ14623 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IHHQ14623 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IHHQ14623 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IHHQ14623 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IHHQ14623 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
IHHQ14623 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IHHQ14623 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms