Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL9A3Q14050 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL9A3Q14050 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms