Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CIRBPQ14011 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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