Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
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