Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
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