Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
KRR1Q13601 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
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