Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 RPL30-206ENST00000518850 614 ntTSL 217.7■□□□□ 0.421e-20■■■■□ 20.8
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PABPC4Q13310 RPL30-201ENST00000287038 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.11e-20■■■■□ 20.8
PABPC4Q13310 RPL30-209ENST00000521291 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.451e-20■■■■□ 20.8
PABPC4Q13310 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.652e-6■■■■□ 20.8
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PABPC4Q13310 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.052e-6■■■■□ 20.8
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PABPC4Q13310 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.812e-6■■■■□ 20.8
PABPC4Q13310 GMPPA-207ENST00000443704 1783 ntTSL 519.55■□□□□ 0.722e-6■■■■□ 20.8
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PABPC4Q13310 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.072e-6■■■■□ 20.8
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PABPC4Q13310 PVT1-214ENST00000522875 922 ntTSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.11e-6■■■■□ 20.8
PABPC4Q13310 PVT1-217ENST00000523190 443 ntTSL 37.6□□□□□ -1.191e-6■■■■□ 20.8
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PABPC4Q13310 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.451e-6■■■■□ 20.8
PABPC4Q13310 CD151-220ENST00000532045 1803 ntTSL 522.83■■□□□ 1.251e-6■■■■□ 20.8
PABPC4Q13310 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.151e-6■■■■□ 20.8
PABPC4Q13310 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.971e-6■■■■□ 20.8
PABPC4Q13310 CD151-218ENST00000530726 1407 ntTSL 515.94■□□□□ 0.141e-6■■■■□ 20.8
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PABPC4Q13310 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.83■□□□□ 0.126e-8■■■■□ 20.7
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PABPC4Q13310 FAM207A-204ENST00000479127 759 ntTSL 322.63■■□□□ 1.214e-8■■■■□ 20.7
PABPC4Q13310 TBL3-204ENST00000567615 1047 ntTSL 220.4■□□□□ 0.861e-9■■■■□ 20.7
PABPC4Q13310 TBL3-201ENST00000332704 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)19.75■□□□□ 0.751e-9■■■■□ 20.7
PABPC4Q13310 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41e-9■■■■□ 20.7
PABPC4Q13310 TBL3-206ENST00000569628 2594 ntTSL 217.35■□□□□ 0.371e-9■■■■□ 20.7
PABPC4Q13310 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.141e-9■■■■□ 20.7
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PABPC4Q13310 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.57e-12■■■■□ 20.7
PABPC4Q13310 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.287e-12■■■■□ 20.7
PABPC4Q13310 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.487e-12■■■■□ 20.7
PABPC4Q13310 RHOC-212ENST00000468093 1042 ntTSL 318.01■□□□□ 0.477e-12■■■■□ 20.7
PABPC4Q13310 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.496e-7■■■■□ 20.7
PABPC4Q13310 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.281e-6■■■■□ 20.7
PABPC4Q13310 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.664e-8■■■■□ 20.7
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PABPC4Q13310 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.43e-6■■■■□ 20.7
PABPC4Q13310 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.463e-6■■■■□ 20.7
PABPC4Q13310 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.643e-6■■■■□ 20.7
PABPC4Q13310 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.355e-8■■■■□ 20.7
PABPC4Q13310 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.955e-8■■■■□ 20.7
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PABPC4Q13310 S100A13-204ENST00000440685 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.922e-7■■■■□ 20.7
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PABPC4Q13310 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.474e-8■■■■□ 20.7
PABPC4Q13310 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.174e-8■■■■□ 20.7
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PABPC4Q13310 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.152e-6■■■■□ 20.6
PABPC4Q13310 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.944e-7■■■■□ 20.6
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PABPC4Q13310 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.381e-7■■■■□ 20.6
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PABPC4Q13310 ARHGEF1-203ENST00000354532 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.161e-7■■■■□ 20.6
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PABPC4Q13310 NFATC3-216ENST00000566301 3840 ntTSL 1 (best)7.15□□□□□ -1.262e-6■■■■□ 20.6
PABPC4Q13310 NFATC3-205ENST00000535127 4194 ntTSL 1 (best)6.99□□□□□ -1.292e-6■■■■□ 20.6
PABPC4Q13310 NFATC3-212ENST00000563288 3790 ntTSL 1 (best)6.93□□□□□ -1.32e-6■■■■□ 20.6
PABPC4Q13310 NFATC3-214ENST00000563796 3753 ntTSL 1 (best)4.9□□□□□ -1.622e-6■■■■□ 20.6
PABPC4Q13310 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.241e-71■■■■□ 20.6
PABPC4Q13310 MCL1-204ENST00000620947 3626 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.071e-71■■■■□ 20.6
PABPC4Q13310 UQCR10-202ENST00000401406 584 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.544e-12■■■■□ 20.6
PABPC4Q13310 UQCR10-201ENST00000330029 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.094e-12■■■■□ 20.6
PABPC4Q13310 SLC4A2-204ENST00000461735 4387 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.14e-7■■■■□ 20.6
PABPC4Q13310 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.194e-7■■■■□ 20.6
PABPC4Q13310 ATXN2L-221ENST00000566946 2162 ntTSL 1 (best)22.76■■□□□ 1.233e-35■■■■□ 20.6
PABPC4Q13310 ATXN2L-213ENST00000564162 770 ntTSL 521.57■■□□□ 1.043e-35■■■■□ 20.6
PABPC4Q13310 ATXN2L-222ENST00000567024 525 ntTSL 320.81■□□□□ 0.923e-35■■■■□ 20.6
PABPC4Q13310 ATXN2L-208ENST00000562583 1933 ntTSL 1 (best)20.69■□□□□ 0.93e-35■■■■□ 20.6
PABPC4Q13310 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.23e-35■■■■□ 20.6
PABPC4Q13310 ATXN2L-211ENST00000563314 4574 ntTSL 516.11■□□□□ 0.173e-35■■■■□ 20.6
PABPC4Q13310 ATXN2L-218ENST00000565971 3264 ntTSL 1 (best)15.78■□□□□ 0.123e-35■■■■□ 20.6
PABPC4Q13310 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.113e-35■■■■□ 20.6
PABPC4Q13310 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.063e-35■■■■□ 20.6
PABPC4Q13310 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.093e-35■■■■□ 20.6
PABPC4Q13310 ATXN2L-201ENST00000325215 3788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.143e-35■■■■□ 20.6
PABPC4Q13310 ATXN2L-203ENST00000340394 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.273e-35■■■■□ 20.6
PABPC4Q13310 SRP72-205ENST00000510663 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.052e-9■■■■□ 20.6
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