Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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