Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC173Q0VFZ6 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms