Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms