Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CYP4F3Q08477 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms