Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABPB1Q06547 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms