Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms