Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms