Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDR2Q01850 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDR2Q01850 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDR2Q01850 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDR2Q01850 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDR2Q01850 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDR2Q01850 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDR2Q01850 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDR2Q01850 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDR2Q01850 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDR2Q01850 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDR2Q01850 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDR2Q01850 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDR2Q01850 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDR2Q01850 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDR2Q01850 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDR2Q01850 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDR2Q01850 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDR2Q01850 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDR2Q01850 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDR2Q01850 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDR2Q01850 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDR2Q01850 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDR2Q01850 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDR2Q01850 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDR2Q01850 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDR2Q01850 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDR2Q01850 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDR2Q01850 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDR2Q01850 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDR2Q01850 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDR2Q01850 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDR2Q01850 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDR2Q01850 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDR2Q01850 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDR2Q01850 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDR2Q01850 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDR2Q01850 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDR2Q01850 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDR2Q01850 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDR2Q01850 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDR2Q01850 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CDR2Q01850 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CDR2Q01850 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDR2Q01850 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDR2Q01850 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDR2Q01850 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDR2Q01850 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDR2Q01850 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDR2Q01850 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDR2Q01850 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDR2Q01850 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDR2Q01850 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDR2Q01850 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDR2Q01850 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDR2Q01850 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CDR2Q01850 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDR2Q01850 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDR2Q01850 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CDR2Q01850 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDR2Q01850 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDR2Q01850 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDR2Q01850 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDR2Q01850 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDR2Q01850 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDR2Q01850 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDR2Q01850 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDR2Q01850 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDR2Q01850 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDR2Q01850 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDR2Q01850 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDR2Q01850 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDR2Q01850 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDR2Q01850 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDR2Q01850 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDR2Q01850 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDR2Q01850 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDR2Q01850 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDR2Q01850 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDR2Q01850 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDR2Q01850 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDR2Q01850 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDR2Q01850 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDR2Q01850 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDR2Q01850 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDR2Q01850 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDR2Q01850 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDR2Q01850 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDR2Q01850 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CDR2Q01850 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDR2Q01850 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDR2Q01850 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDR2Q01850 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDR2Q01850 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDR2Q01850 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDR2Q01850 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDR2Q01850 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDR2Q01850 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDR2Q01850 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDR2Q01850 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms