Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FGD1P98174 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FGD1P98174 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FGD1P98174 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FGD1P98174 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FGD1P98174 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FGD1P98174 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FGD1P98174 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FGD1P98174 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FGD1P98174 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FGD1P98174 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FGD1P98174 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FGD1P98174 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FGD1P98174 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FGD1P98174 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FGD1P98174 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FGD1P98174 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FGD1P98174 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FGD1P98174 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FGD1P98174 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FGD1P98174 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FGD1P98174 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FGD1P98174 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FGD1P98174 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FGD1P98174 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FGD1P98174 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FGD1P98174 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FGD1P98174 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FGD1P98174 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FGD1P98174 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FGD1P98174 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FGD1P98174 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FGD1P98174 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGD1P98174 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGD1P98174 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGD1P98174 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGD1P98174 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGD1P98174 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGD1P98174 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGD1P98174 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGD1P98174 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGD1P98174 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGD1P98174 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGD1P98174 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGD1P98174 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGD1P98174 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGD1P98174 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGD1P98174 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGD1P98174 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGD1P98174 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGD1P98174 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FGD1P98174 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGD1P98174 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGD1P98174 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGD1P98174 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FGD1P98174 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGD1P98174 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGD1P98174 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGD1P98174 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGD1P98174 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGD1P98174 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGD1P98174 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGD1P98174 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGD1P98174 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FGD1P98174 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FGD1P98174 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FGD1P98174 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FGD1P98174 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FGD1P98174 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FGD1P98174 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FGD1P98174 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FGD1P98174 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FGD1P98174 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FGD1P98174 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FGD1P98174 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FGD1P98174 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FGD1P98174 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FGD1P98174 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FGD1P98174 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FGD1P98174 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FGD1P98174 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FGD1P98174 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGD1P98174 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGD1P98174 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGD1P98174 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGD1P98174 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGD1P98174 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGD1P98174 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGD1P98174 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGD1P98174 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGD1P98174 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGD1P98174 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGD1P98174 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGD1P98174 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGD1P98174 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGD1P98174 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGD1P98174 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGD1P98174 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGD1P98174 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGD1P98174 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms