Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUCB2P80303 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms