Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX3P78415 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX3P78415 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX3P78415 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX3P78415 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX3P78415 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX3P78415 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX3P78415 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX3P78415 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX3P78415 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX3P78415 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX3P78415 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX3P78415 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX3P78415 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX3P78415 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX3P78415 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX3P78415 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX3P78415 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX3P78415 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX3P78415 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX3P78415 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX3P78415 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX3P78415 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX3P78415 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX3P78415 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX3P78415 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX3P78415 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRX3P78415 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRX3P78415 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRX3P78415 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRX3P78415 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRX3P78415 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRX3P78415 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRX3P78415 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRX3P78415 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRX3P78415 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRX3P78415 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
IRX3P78415 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRX3P78415 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRX3P78415 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRX3P78415 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRX3P78415 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRX3P78415 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRX3P78415 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRX3P78415 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRX3P78415 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRX3P78415 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRX3P78415 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRX3P78415 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRX3P78415 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRX3P78415 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRX3P78415 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRX3P78415 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRX3P78415 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRX3P78415 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRX3P78415 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRX3P78415 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRX3P78415 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
IRX3P78415 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
IRX3P78415 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRX3P78415 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
IRX3P78415 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRX3P78415 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRX3P78415 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
IRX3P78415 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRX3P78415 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRX3P78415 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRX3P78415 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRX3P78415 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRX3P78415 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRX3P78415 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
IRX3P78415 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRX3P78415 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRX3P78415 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRX3P78415 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRX3P78415 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
IRX3P78415 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
IRX3P78415 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRX3P78415 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IRX3P78415 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IRX3P78415 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IRX3P78415 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IRX3P78415 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IRX3P78415 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IRX3P78415 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IRX3P78415 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IRX3P78415 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IRX3P78415 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IRX3P78415 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
IRX3P78415 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IRX3P78415 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
IRX3P78415 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IRX3P78415 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IRX3P78415 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IRX3P78415 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IRX3P78415 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IRX3P78415 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IRX3P78415 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IRX3P78415 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IRX3P78415 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms