Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms