Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms