Protein–RNA interactions for Protein: P59646

FXYD4, FXYD domain-containing ion transport regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXYD4P59646 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms