Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP9P55211 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP9P55211 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP9P55211 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP9P55211 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP9P55211 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP9P55211 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP9P55211 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP9P55211 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP9P55211 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP9P55211 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP9P55211 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP9P55211 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP9P55211 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP9P55211 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP9P55211 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP9P55211 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP9P55211 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP9P55211 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP9P55211 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP9P55211 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP9P55211 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP9P55211 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP9P55211 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP9P55211 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP9P55211 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP9P55211 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP9P55211 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP9P55211 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP9P55211 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP9P55211 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP9P55211 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP9P55211 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP9P55211 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP9P55211 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CASP9P55211 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CASP9P55211 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CASP9P55211 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CASP9P55211 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CASP9P55211 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP9P55211 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP9P55211 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP9P55211 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP9P55211 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP9P55211 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP9P55211 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP9P55211 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP9P55211 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP9P55211 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP9P55211 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP9P55211 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP9P55211 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP9P55211 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP9P55211 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP9P55211 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP9P55211 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP9P55211 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP9P55211 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP9P55211 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP9P55211 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP9P55211 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP9P55211 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP9P55211 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP9P55211 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP9P55211 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP9P55211 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP9P55211 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP9P55211 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP9P55211 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP9P55211 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP9P55211 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP9P55211 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP9P55211 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP9P55211 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP9P55211 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP9P55211 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP9P55211 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP9P55211 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP9P55211 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP9P55211 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP9P55211 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP9P55211 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP9P55211 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP9P55211 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP9P55211 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP9P55211 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP9P55211 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP9P55211 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP9P55211 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP9P55211 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP9P55211 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP9P55211 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP9P55211 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP9P55211 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP9P55211 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP9P55211 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP9P55211 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP9P55211 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP9P55211 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP9P55211 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms