Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEK4P51957 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEK4P51957 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEK4P51957 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NEK4P51957 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEK4P51957 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEK4P51957 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEK4P51957 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEK4P51957 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEK4P51957 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEK4P51957 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEK4P51957 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEK4P51957 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEK4P51957 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEK4P51957 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEK4P51957 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEK4P51957 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEK4P51957 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEK4P51957 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEK4P51957 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEK4P51957 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEK4P51957 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEK4P51957 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NEK4P51957 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEK4P51957 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEK4P51957 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEK4P51957 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEK4P51957 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEK4P51957 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEK4P51957 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEK4P51957 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEK4P51957 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
NEK4P51957 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEK4P51957 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEK4P51957 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEK4P51957 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEK4P51957 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEK4P51957 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEK4P51957 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEK4P51957 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEK4P51957 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEK4P51957 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEK4P51957 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEK4P51957 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEK4P51957 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEK4P51957 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEK4P51957 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEK4P51957 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEK4P51957 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEK4P51957 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEK4P51957 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEK4P51957 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEK4P51957 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEK4P51957 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEK4P51957 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEK4P51957 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEK4P51957 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEK4P51957 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEK4P51957 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEK4P51957 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEK4P51957 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEK4P51957 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEK4P51957 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEK4P51957 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEK4P51957 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEK4P51957 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEK4P51957 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEK4P51957 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEK4P51957 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEK4P51957 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEK4P51957 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NEK4P51957 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEK4P51957 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NEK4P51957 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NEK4P51957 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEK4P51957 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NEK4P51957 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEK4P51957 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEK4P51957 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEK4P51957 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEK4P51957 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEK4P51957 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEK4P51957 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEK4P51957 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEK4P51957 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEK4P51957 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEK4P51957 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEK4P51957 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEK4P51957 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEK4P51957 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEK4P51957 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEK4P51957 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEK4P51957 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEK4P51957 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEK4P51957 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEK4P51957 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEK4P51957 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEK4P51957 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEK4P51957 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEK4P51957 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms