Protein–RNA interactions for Protein: P48431

SOX2, Transcription factor SOX-2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX2P48431 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOX2P48431 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOX2P48431 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOX2P48431 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOX2P48431 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOX2P48431 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOX2P48431 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOX2P48431 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOX2P48431 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOX2P48431 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOX2P48431 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOX2P48431 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOX2P48431 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOX2P48431 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOX2P48431 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOX2P48431 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOX2P48431 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOX2P48431 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOX2P48431 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOX2P48431 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOX2P48431 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOX2P48431 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOX2P48431 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SOX2P48431 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOX2P48431 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOX2P48431 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOX2P48431 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOX2P48431 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOX2P48431 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOX2P48431 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOX2P48431 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOX2P48431 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOX2P48431 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOX2P48431 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOX2P48431 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOX2P48431 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOX2P48431 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOX2P48431 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOX2P48431 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOX2P48431 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SOX2P48431 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOX2P48431 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOX2P48431 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOX2P48431 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOX2P48431 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOX2P48431 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOX2P48431 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOX2P48431 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOX2P48431 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOX2P48431 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SOX2P48431 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOX2P48431 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOX2P48431 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOX2P48431 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOX2P48431 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOX2P48431 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOX2P48431 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOX2P48431 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOX2P48431 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOX2P48431 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOX2P48431 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOX2P48431 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOX2P48431 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOX2P48431 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOX2P48431 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOX2P48431 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOX2P48431 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOX2P48431 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOX2P48431 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOX2P48431 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOX2P48431 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOX2P48431 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOX2P48431 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOX2P48431 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOX2P48431 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOX2P48431 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOX2P48431 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOX2P48431 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOX2P48431 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOX2P48431 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOX2P48431 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOX2P48431 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOX2P48431 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOX2P48431 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOX2P48431 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOX2P48431 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOX2P48431 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOX2P48431 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOX2P48431 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOX2P48431 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOX2P48431 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOX2P48431 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOX2P48431 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOX2P48431 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOX2P48431 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOX2P48431 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOX2P48431 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOX2P48431 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOX2P48431 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOX2P48431 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms