Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TM4SF4P48230 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TM4SF4P48230 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms