Protein–RNA interactions for Protein: P48147

PREP, Prolyl endopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREPP48147 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PREPP48147 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PREPP48147 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PREPP48147 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PREPP48147 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PREPP48147 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PREPP48147 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PREPP48147 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PREPP48147 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PREPP48147 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PREPP48147 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PREPP48147 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PREPP48147 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PREPP48147 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PREPP48147 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PREPP48147 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PREPP48147 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PREPP48147 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PREPP48147 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PREPP48147 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PREPP48147 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PREPP48147 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PREPP48147 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PREPP48147 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PREPP48147 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PREPP48147 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PREPP48147 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PREPP48147 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PREPP48147 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PREPP48147 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PREPP48147 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PREPP48147 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PREPP48147 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PREPP48147 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PREPP48147 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PREPP48147 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PREPP48147 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PREPP48147 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PREPP48147 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PREPP48147 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PREPP48147 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PREPP48147 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PREPP48147 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PREPP48147 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PREPP48147 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PREPP48147 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PREPP48147 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PREPP48147 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PREPP48147 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PREPP48147 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PREPP48147 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PREPP48147 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PREPP48147 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PREPP48147 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PREPP48147 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PREPP48147 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PREPP48147 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PREPP48147 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PREPP48147 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PREPP48147 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PREPP48147 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PREPP48147 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PREPP48147 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PREPP48147 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PREPP48147 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PREPP48147 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PREPP48147 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PREPP48147 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PREPP48147 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PREPP48147 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PREPP48147 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PREPP48147 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PREPP48147 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PREPP48147 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PREPP48147 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PREPP48147 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PREPP48147 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PREPP48147 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PREPP48147 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PREPP48147 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PREPP48147 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PREPP48147 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PREPP48147 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PREPP48147 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PREPP48147 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PREPP48147 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PREPP48147 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PREPP48147 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PREPP48147 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PREPP48147 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PREPP48147 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PREPP48147 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PREPP48147 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PREPP48147 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PREPP48147 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PREPP48147 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PREPP48147 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PREPP48147 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PREPP48147 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PREPP48147 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms