Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NR4A2P43354 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms