Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms