Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2E2P29084 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms