Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GCAP28676 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GCAP28676 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GCAP28676 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GCAP28676 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GCAP28676 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GCAP28676 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GCAP28676 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GCAP28676 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GCAP28676 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GCAP28676 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GCAP28676 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GCAP28676 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GCAP28676 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GCAP28676 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GCAP28676 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GCAP28676 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GCAP28676 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GCAP28676 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GCAP28676 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GCAP28676 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GCAP28676 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GCAP28676 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GCAP28676 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GCAP28676 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GCAP28676 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GCAP28676 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GCAP28676 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GCAP28676 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GCAP28676 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GCAP28676 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GCAP28676 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GCAP28676 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GCAP28676 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GCAP28676 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GCAP28676 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GCAP28676 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GCAP28676 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GCAP28676 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GCAP28676 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GCAP28676 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GCAP28676 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GCAP28676 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GCAP28676 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GCAP28676 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GCAP28676 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GCAP28676 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GCAP28676 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GCAP28676 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GCAP28676 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GCAP28676 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GCAP28676 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GCAP28676 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GCAP28676 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GCAP28676 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GCAP28676 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GCAP28676 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GCAP28676 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GCAP28676 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GCAP28676 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GCAP28676 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GCAP28676 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GCAP28676 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GCAP28676 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GCAP28676 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GCAP28676 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GCAP28676 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GCAP28676 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GCAP28676 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GCAP28676 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GCAP28676 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GCAP28676 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GCAP28676 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GCAP28676 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GCAP28676 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GCAP28676 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GCAP28676 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GCAP28676 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GCAP28676 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GCAP28676 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GCAP28676 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GCAP28676 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GCAP28676 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GCAP28676 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GCAP28676 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GCAP28676 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GCAP28676 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GCAP28676 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GCAP28676 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GCAP28676 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GCAP28676 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GCAP28676 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GCAP28676 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GCAP28676 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GCAP28676 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GCAP28676 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GCAP28676 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GCAP28676 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GCAP28676 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GCAP28676 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms