Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms