Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms