Protein–RNA interactions for Protein: P17036

ZNF3, Zinc finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3P17036 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF3P17036 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF3P17036 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF3P17036 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF3P17036 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF3P17036 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF3P17036 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF3P17036 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF3P17036 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF3P17036 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF3P17036 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF3P17036 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF3P17036 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF3P17036 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF3P17036 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF3P17036 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF3P17036 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF3P17036 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF3P17036 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF3P17036 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF3P17036 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF3P17036 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF3P17036 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF3P17036 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF3P17036 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF3P17036 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF3P17036 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF3P17036 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF3P17036 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF3P17036 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF3P17036 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF3P17036 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF3P17036 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF3P17036 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF3P17036 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF3P17036 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF3P17036 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF3P17036 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF3P17036 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF3P17036 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF3P17036 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF3P17036 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF3P17036 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF3P17036 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF3P17036 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF3P17036 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF3P17036 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF3P17036 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF3P17036 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF3P17036 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF3P17036 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF3P17036 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF3P17036 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF3P17036 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF3P17036 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF3P17036 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF3P17036 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF3P17036 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF3P17036 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF3P17036 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF3P17036 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF3P17036 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF3P17036 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF3P17036 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF3P17036 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF3P17036 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF3P17036 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF3P17036 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF3P17036 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF3P17036 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF3P17036 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF3P17036 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF3P17036 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF3P17036 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF3P17036 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF3P17036 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF3P17036 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF3P17036 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF3P17036 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF3P17036 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF3P17036 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF3P17036 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF3P17036 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF3P17036 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF3P17036 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF3P17036 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF3P17036 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF3P17036 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF3P17036 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF3P17036 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF3P17036 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF3P17036 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF3P17036 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF3P17036 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF3P17036 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF3P17036 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF3P17036 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF3P17036 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF3P17036 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF3P17036 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms