Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CREB1P16220 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CREB1P16220 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CREB1P16220 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CREB1P16220 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CREB1P16220 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CREB1P16220 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CREB1P16220 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CREB1P16220 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CREB1P16220 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CREB1P16220 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CREB1P16220 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CREB1P16220 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CREB1P16220 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CREB1P16220 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CREB1P16220 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CREB1P16220 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CREB1P16220 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CREB1P16220 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CREB1P16220 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CREB1P16220 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CREB1P16220 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CREB1P16220 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CREB1P16220 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CREB1P16220 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CREB1P16220 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CREB1P16220 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CREB1P16220 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CREB1P16220 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CREB1P16220 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CREB1P16220 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CREB1P16220 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CREB1P16220 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CREB1P16220 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CREB1P16220 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CREB1P16220 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CREB1P16220 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CREB1P16220 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CREB1P16220 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CREB1P16220 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CREB1P16220 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CREB1P16220 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CREB1P16220 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CREB1P16220 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CREB1P16220 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CREB1P16220 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CREB1P16220 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CREB1P16220 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CREB1P16220 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CREB1P16220 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CREB1P16220 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CREB1P16220 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CREB1P16220 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CREB1P16220 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CREB1P16220 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CREB1P16220 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CREB1P16220 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CREB1P16220 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CREB1P16220 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CREB1P16220 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CREB1P16220 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CREB1P16220 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CREB1P16220 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CREB1P16220 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CREB1P16220 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CREB1P16220 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CREB1P16220 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CREB1P16220 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CREB1P16220 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CREB1P16220 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CREB1P16220 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CREB1P16220 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CREB1P16220 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CREB1P16220 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CREB1P16220 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CREB1P16220 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CREB1P16220 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CREB1P16220 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CREB1P16220 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CREB1P16220 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CREB1P16220 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CREB1P16220 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CREB1P16220 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CREB1P16220 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CREB1P16220 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CREB1P16220 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CREB1P16220 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CREB1P16220 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CREB1P16220 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CREB1P16220 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CREB1P16220 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CREB1P16220 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CREB1P16220 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CREB1P16220 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CREB1P16220 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CREB1P16220 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CREB1P16220 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CREB1P16220 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CREB1P16220 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CREB1P16220 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms