Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
VAV1P15498 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VAV1P15498 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VAV1P15498 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VAV1P15498 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VAV1P15498 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VAV1P15498 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VAV1P15498 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VAV1P15498 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VAV1P15498 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
VAV1P15498 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VAV1P15498 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VAV1P15498 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAV1P15498 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
VAV1P15498 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAV1P15498 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAV1P15498 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAV1P15498 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAV1P15498 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAV1P15498 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAV1P15498 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAV1P15498 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAV1P15498 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAV1P15498 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAV1P15498 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAV1P15498 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAV1P15498 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAV1P15498 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAV1P15498 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAV1P15498 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAV1P15498 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAV1P15498 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAV1P15498 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAV1P15498 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAV1P15498 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAV1P15498 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAV1P15498 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAV1P15498 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAV1P15498 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAV1P15498 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAV1P15498 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAV1P15498 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VAV1P15498 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
VAV1P15498 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VAV1P15498 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VAV1P15498 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VAV1P15498 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VAV1P15498 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VAV1P15498 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VAV1P15498 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VAV1P15498 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VAV1P15498 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VAV1P15498 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VAV1P15498 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VAV1P15498 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VAV1P15498 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VAV1P15498 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VAV1P15498 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VAV1P15498 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VAV1P15498 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAV1P15498 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAV1P15498 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAV1P15498 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAV1P15498 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAV1P15498 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAV1P15498 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAV1P15498 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAV1P15498 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAV1P15498 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAV1P15498 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAV1P15498 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAV1P15498 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAV1P15498 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAV1P15498 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAV1P15498 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAV1P15498 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAV1P15498 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAV1P15498 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAV1P15498 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAV1P15498 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAV1P15498 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAV1P15498 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
VAV1P15498 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
VAV1P15498 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAV1P15498 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAV1P15498 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAV1P15498 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAV1P15498 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAV1P15498 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAV1P15498 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAV1P15498 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAV1P15498 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAV1P15498 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAV1P15498 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAV1P15498 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAV1P15498 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAV1P15498 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAV1P15498 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAV1P15498 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAV1P15498 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms