Protein–RNA interactions for Protein: P13521

SCG2, Secretogranin-2, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG2P13521 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCG2P13521 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCG2P13521 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCG2P13521 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCG2P13521 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCG2P13521 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCG2P13521 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCG2P13521 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCG2P13521 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCG2P13521 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCG2P13521 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SCG2P13521 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCG2P13521 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCG2P13521 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCG2P13521 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCG2P13521 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCG2P13521 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCG2P13521 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCG2P13521 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCG2P13521 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCG2P13521 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCG2P13521 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCG2P13521 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCG2P13521 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCG2P13521 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCG2P13521 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCG2P13521 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCG2P13521 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCG2P13521 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCG2P13521 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCG2P13521 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCG2P13521 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCG2P13521 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCG2P13521 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCG2P13521 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCG2P13521 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCG2P13521 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCG2P13521 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCG2P13521 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCG2P13521 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCG2P13521 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCG2P13521 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCG2P13521 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCG2P13521 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCG2P13521 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCG2P13521 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCG2P13521 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCG2P13521 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCG2P13521 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCG2P13521 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCG2P13521 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCG2P13521 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCG2P13521 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SCG2P13521 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCG2P13521 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCG2P13521 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCG2P13521 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCG2P13521 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCG2P13521 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCG2P13521 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCG2P13521 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SCG2P13521 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCG2P13521 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCG2P13521 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCG2P13521 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCG2P13521 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SCG2P13521 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SCG2P13521 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCG2P13521 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCG2P13521 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCG2P13521 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCG2P13521 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCG2P13521 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCG2P13521 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCG2P13521 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCG2P13521 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCG2P13521 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCG2P13521 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCG2P13521 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCG2P13521 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SCG2P13521 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCG2P13521 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCG2P13521 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCG2P13521 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCG2P13521 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCG2P13521 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCG2P13521 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCG2P13521 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCG2P13521 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCG2P13521 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCG2P13521 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCG2P13521 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCG2P13521 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCG2P13521 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCG2P13521 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCG2P13521 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCG2P13521 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCG2P13521 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCG2P13521 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCG2P13521 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms