Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDH1P12830 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDH1P12830 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CDH1P12830 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDH1P12830 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDH1P12830 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDH1P12830 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDH1P12830 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDH1P12830 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDH1P12830 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CDH1P12830 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDH1P12830 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDH1P12830 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDH1P12830 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDH1P12830 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDH1P12830 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDH1P12830 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CDH1P12830 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDH1P12830 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDH1P12830 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDH1P12830 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDH1P12830 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDH1P12830 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDH1P12830 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDH1P12830 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDH1P12830 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDH1P12830 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDH1P12830 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDH1P12830 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDH1P12830 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDH1P12830 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDH1P12830 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDH1P12830 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDH1P12830 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CDH1P12830 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDH1P12830 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDH1P12830 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDH1P12830 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDH1P12830 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDH1P12830 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDH1P12830 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDH1P12830 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDH1P12830 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDH1P12830 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDH1P12830 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDH1P12830 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDH1P12830 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDH1P12830 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDH1P12830 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDH1P12830 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDH1P12830 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDH1P12830 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDH1P12830 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDH1P12830 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDH1P12830 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CDH1P12830 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDH1P12830 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDH1P12830 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDH1P12830 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDH1P12830 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDH1P12830 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDH1P12830 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDH1P12830 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDH1P12830 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDH1P12830 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDH1P12830 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDH1P12830 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDH1P12830 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDH1P12830 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDH1P12830 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDH1P12830 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDH1P12830 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDH1P12830 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDH1P12830 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDH1P12830 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDH1P12830 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDH1P12830 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDH1P12830 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDH1P12830 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CDH1P12830 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDH1P12830 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CDH1P12830 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CDH1P12830 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDH1P12830 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDH1P12830 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDH1P12830 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDH1P12830 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDH1P12830 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDH1P12830 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDH1P12830 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDH1P12830 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDH1P12830 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDH1P12830 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDH1P12830 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDH1P12830 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDH1P12830 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDH1P12830 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDH1P12830 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDH1P12830 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDH1P12830 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms