Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD8BP10966 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD8BP10966 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD8BP10966 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD8BP10966 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD8BP10966 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD8BP10966 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD8BP10966 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD8BP10966 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD8BP10966 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD8BP10966 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD8BP10966 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD8BP10966 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD8BP10966 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD8BP10966 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD8BP10966 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CD8BP10966 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CD8BP10966 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CD8BP10966 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD8BP10966 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD8BP10966 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD8BP10966 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD8BP10966 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD8BP10966 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD8BP10966 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CD8BP10966 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD8BP10966 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD8BP10966 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD8BP10966 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD8BP10966 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD8BP10966 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD8BP10966 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD8BP10966 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD8BP10966 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD8BP10966 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD8BP10966 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD8BP10966 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD8BP10966 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD8BP10966 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD8BP10966 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD8BP10966 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD8BP10966 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD8BP10966 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD8BP10966 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD8BP10966 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD8BP10966 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD8BP10966 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD8BP10966 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD8BP10966 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD8BP10966 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD8BP10966 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD8BP10966 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CD8BP10966 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD8BP10966 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD8BP10966 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD8BP10966 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD8BP10966 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD8BP10966 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD8BP10966 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD8BP10966 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD8BP10966 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD8BP10966 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD8BP10966 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD8BP10966 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD8BP10966 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD8BP10966 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD8BP10966 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD8BP10966 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD8BP10966 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD8BP10966 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD8BP10966 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD8BP10966 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD8BP10966 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD8BP10966 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD8BP10966 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD8BP10966 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD8BP10966 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD8BP10966 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD8BP10966 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD8BP10966 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD8BP10966 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD8BP10966 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD8BP10966 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD8BP10966 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD8BP10966 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD8BP10966 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD8BP10966 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD8BP10966 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD8BP10966 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD8BP10966 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD8BP10966 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD8BP10966 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD8BP10966 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD8BP10966 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD8BP10966 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD8BP10966 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD8BP10966 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CD8BP10966 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD8BP10966 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD8BP10966 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms